Dans un pays moderne où le pouvoir appartient au Shogun Martial et aux samouraïs très respectés vivent les vrais jumeaux de la famille Sakakido. Kou, le garçon, est plutôt efféminé et est très fort en cuisine, aux tâches ménagères et en art. Tsukiko, la fille, est un vrai garçon manqué, adore les combats où elle excelle. Les jumeaux apprennent qu'il existe une école, le lycée Samouraï, où les hommes testent leur force et les femmes leur féminité. Si les jumeaux veulent y entrer, ils doivent se faire passer pour l'autre, donc changer de places. Si leur supercherie est découverte, c'est la mort assurée pour nos jumeaux. Tout en surmontant les difficultés causés par cet échange, ils doivent aussi le maintenir secret...