Dans un monde rappelant le moyen âge, des monstres nommés Yomas se nourrissent des humains depuis la nuits des temps. Les Yomas ont la facultés de se cacher dans des corps humains et de vivre parmi ses derniers pour mieux se nourrir. Pour contrer ces monstres, une organisation fît des expériences sur des hommes afin de créer des guerriers capable de combattre les Yomas. Pour une raison inconnue, l'expérience ne marcha que sur des femmes que les hommes nomment Claymore. Ces femmes sont mi-homme mi-yoma, ce qui fait qu'elles sont capable de détecter des Yomas à proximité mais aussi d'utiliser leurs pouvoirs de Yoma pour les anéantir.