Il fut un temps où les ninjas servaient les seigneurs, en exécutant espionnage, sabotage et assassinat. Bien que cette époque remonte à longtemps, le besoin de se reposer sur la puissance des ninjas n'avait pas disparu. Dans une certaine école, des filles sont entrainées en secret pour devenir des ninjas. Asuka, Katsuragi, Hibari, Ikaruga et Yagyuu sont toutes apprenti-ninja et ont chacune un rouleau contenant des techniques secrètes qu'elles doivent protéger à tout prix. Cette histoire nous montre la vie tumultueuse que ces filles mènent en suivant la voie du ninja !

Adaptation manga du jeu 3DS Senran Kagura sorti en septembre 2011